Конечно, по номеру транзакции вы получите все записи, которые сформировались в момент применения, но вы не найдете строки, которые модифицировались в это время. К примеру, поищите в Developer's Toolkit использование MODIFY для таблицы 254 и посмотрите код, предшествующий найденным строкам. Вам станет понятно, что недостаточно просто удалить все операции по применению, необходимо вернуть всё в то состояние, какое было до применения. Проблема же в том, что мы не знаем, ЧТО

меняется в том или ином случае.
Этот простой пример дает понять, почему отмена операций применения (и остальных тоже) в Navision достаточно трудно исполнима.