Догадка №2
Ты используешь не то действие для загрузки.
X++:
<Action>findListChartOfAccounts</Action>
у этого действия тип 'QueryDocuments'. Axapta считает, что xml-файлы в каталоге указанном в канале - это запросы и проверяет их по схеме QueryCriteria.xsd (что в калаге приложения\Share\Include), а у тебя файл по структуре - входящий документ (тип ReceiveDocument или ReceiveDocumentList) отсюда и ошибка. Попробуй использовать для загрузки действие createListChartOfAccounts или createChartOfAccounts