А не думали документы на Sharepoint хранить? в Ax ссылки на документы в хранить? Кроме настройки прав доступа до файла получите полнотекстовый поиск, версионность, несложный workflow и другие полезные фичи... Все же файловая система не самое лучшее многопользовательское хранилище документов
