Разобрался в чем была проблема. Решил написать, вдруг у кого-то такая же.
Все оказалось просто, но догадываться пришлось наверное неделю
Дело в том, что выставляя способ оплаты в журнале платежей данные Способа оплаты, банковский счет автоматически не переносятся в форму "Создания Платежей" Функции--Создание Платежей.
Это я заметил и поправил.
И кроме этого, так же и номер счета поставщика автоматом не переноситься, а остается последний используемый, его надо выбирать при помощи кнопки "Выбрать" и следить чтоб он соответствовал нужному поставщику.
Вобщем-то и все. После этого чек формируется как надо.
