Писать инструмент для переноса данных.
Когда я работал в СК писал такую вещь для перевода компании на холдинговую структуру. Работа в Аксапте прекращалась на 3 часа. За это время по нажатию большой красной кнопки создавались домены, табличные коллекции, виртуальные компании, склады, соединялись несколько баз и т.п.
Эту вещь я выкладывал на форуме, но только вот поиск не работает...
.
Если не лениво - поищите в разработке.