1. По совсем классическим случаям - позволяет. Как только уходим в сильную специфику какой-нибудь отрасли - возникают трудности. На самом деле еще сильно зависит от основного учета - если РСБУ, то ок. Если хочется нормальный УУ (типа МСФО и т.п.) + РСБУ + НУ, то тут зависит от учетной политики и особенностей бизнеса.
2. MS заявляет, что автоматизированы все налоговые декларации и основные формы. На практике не приходилось использовать стандартный для 4.0 (и 2009) механизм отчетности - подтвердить не могу. Плюс пока по оперативности учета изменений до основного конкурента еще далеко

3. Та же система, что в п.2. позволяет формировать как текстовые, так и xml файлы. Сдача отчетности - в xml.