Боюсь что это технически невозможно реализовать в общем виде. Добавить новые поля - еще ладно, но что сделать с перемещением поля на форме или удалением элементов?
Существует утилита Solution Packager, она была в составе средств CRM 2011 "R8", который так и не вышел. Она умеет потрошить стандартное решение и раскладывать его в структуру каталогов с XML файлами, в том числе с XML форм. Технически вы можете воспользоваться любыми средствами сравнения XML файлов, чтобы просмотреть изменения и даже смержевать их вручную. Приведенная ниже ссылка на вебкаст будет работать только если вы регистрировались в добровольцы-испытатели R8: R8 R8 Virtual Airlift - Solution Building,
https://connect.microsoft.com/site68...wnloadID=42619