Все оказалось просто.
Был Пересчет, в ГК разнеслась сумма. Затем его пытались отменить, и отмена Пересчета зависла. Но это было 05.12.2011. Почему при последующих Пересчетах система не ругнулась, что существует незавершенный расчет и т.д...
Вот эти суммы и зависли. Что теперь с ними делать, не понятно. Ведь чтобы его отменить, нужно отменить все предыдущие Пересчеты, поедет вся БУ отчетность.