[Артем Enot Грунин]

Рекомендую переносить решение в тестовую среду как managed. Это поможет, в том числе, протестировать процесс обновления производственной системы (если, конечно, вы собираетесь использовать в ней managed решения). В случае тестовой системы, удаление управляемого решения решит ваши проблемы рассинхронизации, так как система вернется в начальное состояние. Опять же это все в теории, существуют нюансы. Дополнительно посоветую отобрать у всех желающих всякие права на редактирование тестовой системы.

Если у вас творится хаос подобный описанному (хотя я не имею представления, как такого можно добиться). Проще всего создать новую организацию и дальше мучить ее.