[GeorgeVk]

Не вижу противоречия.
У Вас учет ведется в рублях и есть договорные отношения с клиентом о расчетах в какой-то иной валюте. В результате ряда операций оказывается, что в иной валюте он Вам ничего не должен (и Вы ему), но в рублях переплатил 100 руб.
Для того, чтобы учет в разных валютах коррелировал, необходимо привести сальдо в этих валютах в соответствие. Т.е. если в у.е. 0, то и в руб. должно быть 0. Вот и появляется проводка на 100руб. и 0 у.е.
С точки зрения мультивалютного учета все нормально.
Есть одно но. Аксапта приводит в соответствие расчеты в базовой валюте к расчетам в любой другой валюте. Т.е. если Вы захотите чтобы переоценка происходила не по базовой валюте (к примеру 100у.е. = 0руб.) ничего не получится.