На мой взгляд, изменение скулем кода датаэрии не должно сказаться на целостности справочных данных. Вы ж не InventTrans там меняете или LedgerTrans. А вот с планом счетов надо поосторожнее - смотрите, что бы он совпадал еще до объединения. Иначе черевато.
Эх... сначала надо было думать... вот так всегда... Новое требование и пол-архитектуры к чертям. А уже и данные набиты.
С Уважением,
Георгий