у нас была такая ситуация в момент запуска. формировали остатки на 19, 08, 60 счетах с расчетом в последствии частично использовать бизнес логику системы ( очень спорная радость). Для этого мы создали в плане счетов (ГК) технический счет "ммм", в РСП - профиль разноски по поставщикам с итоговый = "ммм" .. Затем создаем журнальчик (общий ГК) указываем 19 счет, НГ -если 19 счет налоговый, в корреспонденции с типом счета "поставщик". На закладке "накладная" указываем профиль разноски "ммм". По моему есть еще варианты.
Все зависит от того что вы в последствии собираетесь делать с НДС. Однако, если вы затрагиваете счет Поставщика ( тип счета ="поставщик") - задолженность по этому поставщику неизбежно возникнет .. независимо от профиля разноски
)