Сбор проекта после обновления

[Arahnid]

При попытке собрать проект после обновления база отваливается и выводит ошибку винды. Все этапы обновления пройдены. Нигде не ругался и все хорошо. Почему это с ним?
Сразу скажу, что работаю под 2-кой, на сервере АОС. Свободного места много и на АОС и на СКУЛЬ с Аксаптой. Права полные - админские.
Делаю ночью, сервер явно не перегружен обращениями пользователей.
Сервак работает нормально, валится только на этом.

А еще не ясно. Как обновляют программу. У нас сильно измененная программа. Обновить кусок могу, а обновить весь слой - нет. Как в этом случае обычно поступают?
Как решается вопрос с тем, что коды полей имеют одинаковое название, но разный код на разных слоях. Аналогичный вопрос и про таблицы.

Где обо всем этом конкретно почитать? Просто общих статей я уже учиталась.