с чего начать?

[Yoil]

На самом деле надо и 1) и 2).
Касаемо 1): требуйте, чтоб в списке версий в обджект дизайнере на каждом модифицированном объекте стоял код задачи (например, если объект модифицировался под задачи А01, М23 и ЕН12, то в списке версий должно быть перечисленно А01;М23;ЕН12).
В самом коде в объекте тоже доработки должны быть выделены
Во-первых, в триггере Documentation написано что-нибудь вроде
26/09/07 Mega}{aker V03 Правил функцию CheckCreateAndDestroyAll
Далее, в самой функции CheckCreateAndDestroyAll модифицированный код выделен как-нить наподобие
// V03 26/09/07 Mega}{aker >>
код...
// V03 26/09/07 Mega}{aker <<
А вот в пункте 2), в перечне, должно быть уже описание задачи с кодом V03, A01 и т.д.

Таким образом, из 2) вы будете иметь общие представления о доработках системы, а из 1) будете иметь возможность быстро найти и опознать все эти модификации.
Другое дело, не факт, что поставщики будут все это делать...