Прямое обращение к СУБД, минуя Axapta

[e-Car]

Если приложение будет грузить SQL Server тяжёлыми запросами, если запросы будут написаны некорректно и будут "вешать" эксклюзивные блокировки, то последствия будут плохо предсказуемыми.
Вообще, "сажать" два транзакционных приложения на одну базу чревато взаимными блокировками (Axapta не догадывается, что она не одна...). Если же речь идет об аналитическом приложении, то его уж точно надо строить над хранилищем данных, куда по тем или иным правилам переносить информацию из транзакционной системы.