Вопрос в том, нужно ли ее "джойнить" к EmplTable, RpayHistory, в случае, когда не нужно анализировать штат или когда привязка сотрудника к подраздению берется из истории?
Нет, не нужно.
Между EmplTable и RHRMVirtualNetworkTable логическая связь: "обязательное 1:1".
Нарушение этой связи вполне можно считать нарушением логической целостности.