оборотная ведомость по складу необходимо добавить ещё один фильтр

[sukhanchik]

Против непосредственно наложения фильтра ничего не имею, но... почему Вы решили что все складские операции (searchInventTrans) порождены из складских журналов (InventJournalTrans)? Да и разнесенный складской журнал - в общем-то никто не мешает удалить (если это не запрещали в рамках доработки).

Тут более правильно будет не джойниться с InventTrans, а уже внутри цикла каждый раз делать find к InventJournalTrans. Это конечно будет медленнее. Ну либо - not exists join к InventJournalTrans, где поле UNS_IsPererabotka == NoYes::Yes. Но этот запрос тоже надо замерять по времени