Не вся сумма коррекции себестоимости попадает в ГК

[fed]

Скорее всего - -эти коррекции выполнены по тем складским проводкам, по которым изначально не случалось разноски в ГК - например по проводкам переноса, карантинного заказа или чего-то подобного. Для таких проводок сумма коррекции в inventSettlement при закрытии/пересчете пишеться, а разноска, счета и аналитики - нет. А класс inventAdjPost, который данные из inventSettlement в ГК разносит, как раз и игнорирует те записи в которых поля с разноской не заполнены.
Так что все нормально.